تملك كل من مصر واليابان تاريخاً ثرياً من العلاقات الشاملة في كل المجالات السياسية والاقتصادية والثقافية وغيرها. فعلى الصعيد السياسي، توافقت إلى حد كبري رؤى مصر واليابان على مدى نصف القرن الأخير سواء بالنسبة للقضايا في منطقة الشرق الاوسط أو في آسيا أو على المستوى العالمي.